提取後的腸道菌群樣本可以通過以下方法進行鑒定：
顯微鏡觀察法：将提取的腸道菌群樣本塗片或培養後，通過顯微鏡觀察菌群的形态、大小、染色特性等表型特征，結合已知的腸道菌群形态學特征，對菌群進行初步鑒定。
培養法：将提取的腸道菌群樣本接種到适當的培養基上進行培養，觀察菌落的特征、生長速度、對氧氣的需求等，結合已知的培養特征，對菌群進行進一步鑒定。
分子生物學方法：采用PCR、qPCR等技術，對提取的腸道菌群樣本進行基因組DNA的擴增和測序，結合已知的基因組信息和進化關系，對菌群進行更爲精準的鑒定。
生物信息學分析：将通過顯微鏡觀察法、培養法、分子生物學方法等得到的菌群數據，利用生物信息學軟件和工具進行數據分析和解讀，獲得菌群的分類學信息和基因組學特征，對菌群進行全面鑒定。
需要注意的是，腸道菌群鑒定需要綜合運用多種方法，以獲得更準确的結果。同時，由于腸道菌群的多樣性和動态變化，鑒定結果需要結合個體差異和臨床背景進行綜合分析。